Agger Havn er et dejligt område, som ligger øst for byen. Havnen lå tidligere for enden af Fjordvej i Agger men blev flyttet til den nuværende placering i 1971 i forbindelse med etableringen af færgeoverfarten Thyborøn- Agger Tange.
Havnen er stadig en aktiv arbejdsplads med 2 værfter og nogle få fiskerkuttere. Det er også muligt at overnatte på havnen i en såkaldt vandshelter, - eller du og familien kan benytte Opdagelsesplatformen til at studere livet i vandet.
I 2 rækker ligger de små gamle fiskerhuse ned mod fjorden. Den lille vej øst for molen hedder Guldkysten.
På havnen finder man også Vestervig Ro- og Kajakklub, Agger Fiskebil og restauranten Agger Darling.